1、1反恐特战队队长钟原在执行任务中，击毙猛犸组织二号人物引来复仇在解救妻子赵欣的行动中钟原被注射病毒倍受折磨DK生物公司董事长江寒邀请初恋情人生化专业高材生的赵欣及其父亲参加公司“有益菌”研究2反恐指挥中心根。
2、在指挥车里，常指挥长对杨灿说，你看，这些训练有素的特警队员是你爸爸带的徒弟，既然你吃不了这个苦，就送你回家杨灿在指挥车的屏幕里看到了特战队员英勇果敢的反恐过程，心里又燃烧起当特种兵的热情，决心不离开反恐。
3、神鹰反恐特战队接到了一起恐怖袭击的报警电话，他们立刻出发前往现场到达后，他们发现一座建筑物被恐怖分子占据，人员被困在建筑内队长下令小组分散进入建筑，进行逐层搜查，解救被困人员在搜查过程中，队员们遭遇了反恐分。
4、本集开头，神鹰团队得到了一份情报，称有一批激进分子正在计划发动一次大规模的恐怖袭击神鹰团队立即行动起来，展开监视和搜捕行动在调查中，神鹰团队发现这批激进分子的头目是名叫哈希米的人，他一直在不同的国家之间跳操。
5、大结局剧情如下柳诗文打电话告诉杨灿说杨爱萍因为过度劳累导致发病的事，不过现在没有大碍，而林指山也在家里杨爱萍说饿了，支开林指山出去帮她买吃的，趁此跟柳诗文提出林指山有问题，最近林指山一直偷看她电脑里APR项目的。
6、本集故事主要讲述神鹰反恐特战队成员在执行抓捕恐怖分子的任务过程中，遭遇了严重的挫折和困境他们得到了情报，说在某个地区有一伙恐怖分子机关，正在策划一起大规模的恐怖袭击，并且他们有可能携带着制造核武器的材料因此。
7、第32集燃情之夜为了取得神鹰反恐特战队的支持，马克等一众黑帮分子到德国收购了一批荷枪实弹的武器，希望通过这些武器能够得到神鹰反恐特战队的帮助，从而在犯罪道路上更进一步神鹰反恐特战队接到了一起关于黑帮分子的袭击。
8、“老总”派人把飞机上逃脱的黑日组织成员送去南方出境反劫机行动取得胜利，那敏杨灿赵晓波三人荣获个人二等功一次诗文回来后总是做恶梦，梦见杨灿在飞机上被枪击中的场景杨爱萍找诗文谈心，她知道诗文对杨灿的感情。
9、本集开始，神鹰反恐特战队接到了一起重要的情报，疑似恐怖分子正在计划一次大规模袭击，目标是一座重要的政府建筑为了防止此次袭击的发生，神鹰队立即展开了调查和部署队员们分头前往各个可能的目标地点，进行守卫和搜查在。
